Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB39BQ96DA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB39BQ96DA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms