Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC59Q96AG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC59Q96AG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC59Q96AG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LRRC59Q96AG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC59Q96AG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC59Q96AG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC59Q96AG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC59Q96AG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC59Q96AG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC59Q96AG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC59Q96AG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms