Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC4Q8WW27 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC4Q8WW27 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC4Q8WW27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms