Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GSDMBQ8TAX9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMBQ8TAX9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSDMBQ8TAX9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSDMBQ8TAX9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSDMBQ8TAX9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms