Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
IGSF1Q8N6C5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IGSF1Q8N6C5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IGSF1Q8N6C5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IGSF1Q8N6C5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
IGSF1Q8N6C5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IGSF1Q8N6C5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms