Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PARP9Q8IXQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PARP9Q8IXQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PARP9Q8IXQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARP9Q8IXQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARP9Q8IXQ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157 ms