Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPACA3Q8IXA5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPACA3Q8IXA5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SPACA3Q8IXA5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPACA3Q8IXA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms