Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SKAP1Q86WV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SKAP1Q86WV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SKAP1Q86WV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SKAP1Q86WV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
SKAP1Q86WV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SKAP1Q86WV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms