Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q71RC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q71RC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q71RC1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q71RC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q71RC1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q71RC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q71RC1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q71RC1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q71RC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q71RC1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q71RC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q71RC1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q71RC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q71RC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q71RC1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q71RC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q71RC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q71RC1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q71RC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q71RC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q71RC1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q71RC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q71RC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q71RC1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q71RC1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q71RC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q71RC1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q71RC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q71RC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q71RC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q71RC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Q71RC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q71RC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q71RC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q71RC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q71RC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q71RC1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q71RC1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q71RC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q71RC1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q71RC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q71RC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q71RC1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q71RC1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q71RC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q71RC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q71RC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q71RC1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q71RC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q71RC1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q71RC1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q71RC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q71RC1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q71RC1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q71RC1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q71RC1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q71RC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q71RC1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q71RC1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q71RC1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q71RC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q71RC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q71RC1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q71RC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q71RC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q71RC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q71RC1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Q71RC1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q71RC1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q71RC1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q71RC1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q71RC1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q71RC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q71RC1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q71RC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q71RC1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q71RC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q71RC1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms