Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF544Q6NX49 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF544Q6NX49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF544Q6NX49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms