Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCN8Q6JVE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCN8Q6JVE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCN8Q6JVE9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCN8Q6JVE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCN8Q6JVE9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCN8Q6JVE9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms