Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC9A4Q6AI14 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A4Q6AI14 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A4Q6AI14 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A4Q6AI14 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A4Q6AI14 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms