Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BROXQ5VW32 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BROXQ5VW32 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BROXQ5VW32 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BROXQ5VW32 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.9 ms