Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP47Q5SQN1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP47Q5SQN1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNAP47Q5SQN1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP47Q5SQN1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms