Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDRF1Q3B7T1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDRF1Q3B7T1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDRF1Q3B7T1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDRF1Q3B7T1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDRF1Q3B7T1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDRF1Q3B7T1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDRF1Q3B7T1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDRF1Q3B7T1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms