Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFX4Q33E94 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX4Q33E94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX4Q33E94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX4Q33E94 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms