Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM249Q2WGJ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM249Q2WGJ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM249Q2WGJ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM249Q2WGJ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms