Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSG1Q2KHT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSG1Q2KHT4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSG1Q2KHT4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSG1Q2KHT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSG1Q2KHT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms