Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ME3Q16798 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ME3Q16798 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ME3Q16798 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ME3Q16798 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ME3Q16798 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ME3Q16798 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ME3Q16798 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ME3Q16798 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ME3Q16798 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ME3Q16798 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ME3Q16798 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ME3Q16798 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ME3Q16798 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ME3Q16798 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ME3Q16798 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ME3Q16798 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ME3Q16798 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ME3Q16798 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ME3Q16798 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ME3Q16798 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ME3Q16798 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ME3Q16798 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ME3Q16798 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ME3Q16798 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ME3Q16798 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ME3Q16798 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ME3Q16798 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ME3Q16798 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ME3Q16798 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ME3Q16798 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ME3Q16798 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ME3Q16798 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ME3Q16798 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ME3Q16798 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ME3Q16798 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ME3Q16798 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ME3Q16798 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ME3Q16798 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ME3Q16798 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ME3Q16798 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ME3Q16798 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ME3Q16798 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ME3Q16798 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ME3Q16798 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ME3Q16798 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ME3Q16798 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ME3Q16798 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ME3Q16798 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ME3Q16798 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ME3Q16798 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ME3Q16798 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ME3Q16798 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ME3Q16798 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ME3Q16798 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ME3Q16798 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ME3Q16798 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ME3Q16798 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ME3Q16798 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ME3Q16798 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ME3Q16798 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ME3Q16798 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ME3Q16798 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ME3Q16798 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ME3Q16798 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ME3Q16798 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ME3Q16798 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ME3Q16798 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ME3Q16798 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ME3Q16798 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ME3Q16798 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ME3Q16798 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ME3Q16798 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ME3Q16798 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ME3Q16798 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ME3Q16798 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ME3Q16798 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ME3Q16798 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ME3Q16798 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ME3Q16798 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ME3Q16798 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ME3Q16798 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ME3Q16798 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ME3Q16798 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ME3Q16798 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ME3Q16798 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ME3Q16798 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ME3Q16798 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ME3Q16798 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ME3Q16798 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ME3Q16798 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ME3Q16798 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ME3Q16798 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ME3Q16798 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
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