Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNCBQ16143 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNCBQ16143 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNCBQ16143 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNCBQ16143 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms