Protein–RNA interactions for Protein: Q15678

PTPN14, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 14, humanhuman

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN14Q15678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN14Q15678 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN14Q15678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN14Q15678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN14Q15678 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN14Q15678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN14Q15678 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms