Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNPS1Q15287 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNPS1Q15287 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNPS1Q15287 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms