Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RASGEF1BQ0VAM2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms