Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNEQ04844 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNEQ04844 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNEQ04844 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNEQ04844 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNEQ04844 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms