Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUCB1Q02818 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUCB1Q02818 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUCB1Q02818 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUCB1Q02818 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUCB1Q02818 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUCB1Q02818 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms