Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B2Q01814 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B2Q01814 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B2Q01814 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP2B2Q01814 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B2Q01814 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms