Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN1Q01082 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBN1Q01082 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBN1Q01082 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN1Q01082 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN1Q01082 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms