Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM3P98179 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM3P98179 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM3P98179 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM3P98179 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM3P98179 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM3P98179 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM3P98179 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBM3P98179 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBM3P98179 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBM3P98179 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBM3P98179 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBM3P98179 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBM3P98179 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM3P98179 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM3P98179 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM3P98179 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM3P98179 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBM3P98179 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBM3P98179 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBM3P98179 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBM3P98179 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBM3P98179 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBM3P98179 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBM3P98179 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBM3P98179 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBM3P98179 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBM3P98179 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBM3P98179 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBM3P98179 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBM3P98179 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBM3P98179 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBM3P98179 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBM3P98179 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBM3P98179 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBM3P98179 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBM3P98179 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBM3P98179 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBM3P98179 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBM3P98179 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM3P98179 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM3P98179 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM3P98179 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM3P98179 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM3P98179 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM3P98179 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM3P98179 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM3P98179 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM3P98179 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM3P98179 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM3P98179 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM3P98179 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM3P98179 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM3P98179 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM3P98179 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM3P98179 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM3P98179 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms