Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELNP78509 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELNP78509 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELNP78509 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELNP78509 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELNP78509 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELNP78509 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELNP78509 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELNP78509 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELNP78509 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELNP78509 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELNP78509 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELNP78509 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELNP78509 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELNP78509 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELNP78509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELNP78509 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELNP78509 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RELNP78509 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RELNP78509 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RELNP78509 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELNP78509 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELNP78509 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELNP78509 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELNP78509 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RELNP78509 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RELNP78509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELNP78509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELNP78509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELNP78509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELNP78509 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELNP78509 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELNP78509 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELNP78509 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELNP78509 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELNP78509 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RELNP78509 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELNP78509 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELNP78509 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RELNP78509 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RELNP78509 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELNP78509 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELNP78509 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELNP78509 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELNP78509 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RELNP78509 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELNP78509 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELNP78509 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RELNP78509 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELNP78509 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RELNP78509 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELNP78509 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELNP78509 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELNP78509 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELNP78509 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELNP78509 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELNP78509 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RELNP78509 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELNP78509 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELNP78509 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELNP78509 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RELNP78509 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELNP78509 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELNP78509 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELNP78509 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELNP78509 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RELNP78509 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELNP78509 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELNP78509 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELNP78509 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELNP78509 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELNP78509 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RELNP78509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELNP78509 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RELNP78509 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELNP78509 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELNP78509 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELNP78509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELNP78509 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELNP78509 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELNP78509 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELNP78509 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RELNP78509 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELNP78509 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELNP78509 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELNP78509 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELNP78509 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELNP78509 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms