Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS4XP62701 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS4XP62701 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS4XP62701 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS4XP62701 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms