Protein–RNA interactions for Protein: P61619

SEC61A1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61A1P61619 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC61A1P61619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC61A1P61619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC61A1P61619 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC61A1P61619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms