Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB38P57729 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB38P57729 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB38P57729 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB38P57729 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB38P57729 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB38P57729 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB38P57729 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB38P57729 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB38P57729 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB38P57729 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB38P57729 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB38P57729 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB38P57729 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB38P57729 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB38P57729 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB38P57729 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB38P57729 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB38P57729 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB38P57729 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB38P57729 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB38P57729 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB38P57729 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB38P57729 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB38P57729 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB38P57729 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB38P57729 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB38P57729 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB38P57729 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB38P57729 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB38P57729 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB38P57729 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB38P57729 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB38P57729 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB38P57729 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB38P57729 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB38P57729 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB38P57729 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB38P57729 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB38P57729 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB38P57729 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB38P57729 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB38P57729 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB38P57729 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB38P57729 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB38P57729 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB38P57729 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB38P57729 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB38P57729 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB38P57729 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB38P57729 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB38P57729 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB38P57729 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB38P57729 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB38P57729 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB38P57729 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB38P57729 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB38P57729 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms