Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MTCP1P56278 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTCP1P56278 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTCP1P56278 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTCP1P56278 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms