Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMK2P53671 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK2P53671 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LIMK2P53671 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK2P53671 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms