Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA4P51532 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA4P51532 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
SMARCA4P51532 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC47.26■■■■■ 5.16
SMARCA4P51532 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.24■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SMARCA4P51532 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC47.14■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
SMARCA4P51532 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
SMARCA4P51532 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
SMARCA4P51532 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC46.94■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC46.94■■■■■ 5.11
SMARCA4P51532 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
SMARCA4P51532 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC46.84■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
SMARCA4P51532 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms