Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRP9P49458 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP9P49458 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP9P49458 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP9P49458 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP9P49458 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP9P49458 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRP9P49458 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP9P49458 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP9P49458 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP9P49458 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP9P49458 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP9P49458 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRP9P49458 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP9P49458 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP9P49458 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP9P49458 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP9P49458 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRP9P49458 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP9P49458 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP9P49458 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP9P49458 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP9P49458 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRP9P49458 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP9P49458 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRP9P49458 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP9P49458 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP9P49458 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP9P49458 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP9P49458 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP9P49458 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP9P49458 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP9P49458 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP9P49458 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP9P49458 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP9P49458 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP9P49458 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP9P49458 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP9P49458 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP9P49458 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP9P49458 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP9P49458 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP9P49458 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP9P49458 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP9P49458 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP9P49458 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP9P49458 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP9P49458 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP9P49458 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP9P49458 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP9P49458 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP9P49458 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP9P49458 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP9P49458 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP9P49458 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP9P49458 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP9P49458 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP9P49458 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP9P49458 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP9P49458 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP9P49458 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP9P49458 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP9P49458 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP9P49458 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP9P49458 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP9P49458 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP9P49458 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP9P49458 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP9P49458 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP9P49458 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP9P49458 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP9P49458 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP9P49458 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP9P49458 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms