Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PITPNBP48739 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNBP48739 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNBP48739 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNBP48739 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms