Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA3P42263 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA3P42263 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIA3P42263 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA3P42263 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA3P42263 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms