Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX19P40855 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX19P40855 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX19P40855 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX19P40855 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX19P40855 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX19P40855 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX19P40855 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX19P40855 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX19P40855 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX19P40855 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX19P40855 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX19P40855 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX19P40855 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX19P40855 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX19P40855 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX19P40855 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX19P40855 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX19P40855 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX19P40855 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX19P40855 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX19P40855 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX19P40855 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX19P40855 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX19P40855 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX19P40855 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX19P40855 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX19P40855 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX19P40855 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX19P40855 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX19P40855 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX19P40855 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX19P40855 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX19P40855 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX19P40855 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX19P40855 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX19P40855 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX19P40855 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX19P40855 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX19P40855 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX19P40855 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX19P40855 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX19P40855 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX19P40855 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX19P40855 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX19P40855 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX19P40855 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX19P40855 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX19P40855 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX19P40855 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX19P40855 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PEX19P40855 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX19P40855 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX19P40855 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX19P40855 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX19P40855 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX19P40855 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX19P40855 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX19P40855 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX19P40855 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX19P40855 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX19P40855 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PEX19P40855 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX19P40855 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX19P40855 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX19P40855 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX19P40855 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX19P40855 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX19P40855 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX19P40855 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX19P40855 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX19P40855 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX19P40855 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms