Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHI3L1P36222 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHI3L1P36222 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHI3L1P36222 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms