Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCR5P32302 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CXCR5P32302 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCR5P32302 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCR5P32302 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CXCR5P32302 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms