Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CPS1P31327 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CPS1P31327 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CPS1P31327 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CPS1P31327 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CPS1P31327 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CPS1P31327 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CPS1P31327 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CPS1P31327 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CPS1P31327 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CPS1P31327 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPS1P31327 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPS1P31327 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CPS1P31327 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CPS1P31327 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CPS1P31327 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CPS1P31327 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CPS1P31327 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CPS1P31327 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CPS1P31327 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CPS1P31327 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CPS1P31327 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CPS1P31327 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CPS1P31327 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPS1P31327 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPS1P31327 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPS1P31327 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPS1P31327 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPS1P31327 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CPS1P31327 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CPS1P31327 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CPS1P31327 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CPS1P31327 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CPS1P31327 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CPS1P31327 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CPS1P31327 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CPS1P31327 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CPS1P31327 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CPS1P31327 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CPS1P31327 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CPS1P31327 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CPS1P31327 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CPS1P31327 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CPS1P31327 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CPS1P31327 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CPS1P31327 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CPS1P31327 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CPS1P31327 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CPS1P31327 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CPS1P31327 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CPS1P31327 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CPS1P31327 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CPS1P31327 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37■■■■□ 3.51
CPS1P31327 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CPS1P31327 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CPS1P31327 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CPS1P31327 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CPS1P31327 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CPS1P31327 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CPS1P31327 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CPS1P31327 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CPS1P31327 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CPS1P31327 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CPS1P31327 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CPS1P31327 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CPS1P31327 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CPS1P31327 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CPS1P31327 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CPS1P31327 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CPS1P31327 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CPS1P31327 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CPS1P31327 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
CPS1P31327 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CPS1P31327 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CPS1P31327 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CPS1P31327 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CPS1P31327 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CPS1P31327 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CPS1P31327 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CPS1P31327 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CPS1P31327 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CPS1P31327 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CPS1P31327 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CPS1P31327 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CPS1P31327 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CPS1P31327 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CPS1P31327 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CPS1P31327 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CPS1P31327 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CPS1P31327 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CPS1P31327 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CPS1P31327 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CPS1P31327 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CPS1P31327 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CPS1P31327 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CPS1P31327 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CPS1P31327 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CPS1P31327 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CPS1P31327 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CPS1P31327 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms