Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD34P28906 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD34P28906 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD34P28906 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD34P28906 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD34P28906 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD34P28906 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD34P28906 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD34P28906 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD34P28906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD34P28906 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD34P28906 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD34P28906 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD34P28906 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD34P28906 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD34P28906 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD34P28906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD34P28906 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD34P28906 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD34P28906 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD34P28906 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD34P28906 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD34P28906 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD34P28906 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD34P28906 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD34P28906 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD34P28906 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD34P28906 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD34P28906 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD34P28906 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD34P28906 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD34P28906 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD34P28906 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD34P28906 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD34P28906 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD34P28906 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD34P28906 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD34P28906 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD34P28906 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD34P28906 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD34P28906 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD34P28906 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD34P28906 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD34P28906 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD34P28906 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD34P28906 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD34P28906 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD34P28906 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD34P28906 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD34P28906 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD34P28906 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD34P28906 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD34P28906 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD34P28906 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD34P28906 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD34P28906 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD34P28906 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD34P28906 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD34P28906 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD34P28906 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD34P28906 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD34P28906 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD34P28906 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms