Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCSHP23434 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCSHP23434 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCSHP23434 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCSHP23434 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCSHP23434 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCSHP23434 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCSHP23434 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCSHP23434 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCSHP23434 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCSHP23434 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCSHP23434 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCSHP23434 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCSHP23434 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCSHP23434 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCSHP23434 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCSHP23434 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCSHP23434 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCSHP23434 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCSHP23434 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCSHP23434 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSHP23434 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSHP23434 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSHP23434 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSHP23434 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCSHP23434 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSHP23434 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSHP23434 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCSHP23434 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSHP23434 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSHP23434 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSHP23434 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCSHP23434 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCSHP23434 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCSHP23434 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCSHP23434 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCSHP23434 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCSHP23434 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCSHP23434 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCSHP23434 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCSHP23434 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCSHP23434 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCSHP23434 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCSHP23434 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCSHP23434 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCSHP23434 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCSHP23434 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCSHP23434 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCSHP23434 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCSHP23434 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCSHP23434 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms