Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP8P22894 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP8P22894 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP8P22894 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP8P22894 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP8P22894 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP8P22894 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP8P22894 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP8P22894 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP8P22894 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP8P22894 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP8P22894 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP8P22894 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP8P22894 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP8P22894 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP8P22894 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP8P22894 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP8P22894 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP8P22894 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP8P22894 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP8P22894 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP8P22894 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP8P22894 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP8P22894 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP8P22894 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP8P22894 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP8P22894 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MMP8P22894 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MMP8P22894 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP8P22894 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP8P22894 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP8P22894 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP8P22894 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP8P22894 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP8P22894 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP8P22894 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP8P22894 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP8P22894 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP8P22894 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP8P22894 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP8P22894 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP8P22894 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP8P22894 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP8P22894 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP8P22894 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP8P22894 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP8P22894 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP8P22894 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP8P22894 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP8P22894 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP8P22894 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP8P22894 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP8P22894 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MMP8P22894 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP8P22894 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP8P22894 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP8P22894 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP8P22894 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP8P22894 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP8P22894 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP8P22894 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP8P22894 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP8P22894 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP8P22894 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP8P22894 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP8P22894 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP8P22894 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMP8P22894 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP8P22894 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP8P22894 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP8P22894 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP8P22894 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP8P22894 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP8P22894 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP8P22894 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP8P22894 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP8P22894 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP8P22894 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP8P22894 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP8P22894 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP8P22894 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP8P22894 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP8P22894 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP8P22894 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP8P22894 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MMP8P22894 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP8P22894 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms