Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNOP22674 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNOP22674 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNOP22674 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNOP22674 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNOP22674 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNOP22674 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNOP22674 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNOP22674 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNOP22674 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNOP22674 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNOP22674 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNOP22674 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNOP22674 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNOP22674 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNOP22674 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNOP22674 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNOP22674 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNOP22674 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNOP22674 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNOP22674 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNOP22674 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNOP22674 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNOP22674 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNOP22674 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNOP22674 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNOP22674 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNOP22674 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNOP22674 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNOP22674 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNOP22674 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNOP22674 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNOP22674 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNOP22674 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNOP22674 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNOP22674 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNOP22674 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNOP22674 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNOP22674 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNOP22674 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNOP22674 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNOP22674 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNOP22674 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNOP22674 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNOP22674 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNOP22674 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNOP22674 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNOP22674 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNOP22674 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNOP22674 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNOP22674 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNOP22674 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNOP22674 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNOP22674 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNOP22674 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNOP22674 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNOP22674 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNOP22674 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNOP22674 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNOP22674 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNOP22674 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNOP22674 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNOP22674 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNOP22674 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNOP22674 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNOP22674 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNOP22674 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNOP22674 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNOP22674 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNOP22674 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNOP22674 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNOP22674 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNOP22674 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNOP22674 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNOP22674 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNOP22674 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNOP22674 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNOP22674 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNOP22674 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNOP22674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNOP22674 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms