Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS4Y1P22090 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4Y1P22090 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS4Y1P22090 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS4Y1P22090 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms