Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CREB1P16220 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB1P16220 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB1P16220 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB1P16220 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CREB1P16220 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CREB1P16220 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB1P16220 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB1P16220 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB1P16220 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CREB1P16220 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB1P16220 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB1P16220 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB1P16220 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB1P16220 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CREB1P16220 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB1P16220 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB1P16220 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CREB1P16220 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB1P16220 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB1P16220 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB1P16220 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CREB1P16220 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB1P16220 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CREB1P16220 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB1P16220 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB1P16220 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB1P16220 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB1P16220 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB1P16220 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB1P16220 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB1P16220 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB1P16220 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB1P16220 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB1P16220 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB1P16220 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB1P16220 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB1P16220 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB1P16220 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB1P16220 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB1P16220 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB1P16220 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB1P16220 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB1P16220 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB1P16220 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB1P16220 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB1P16220 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB1P16220 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB1P16220 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB1P16220 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB1P16220 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB1P16220 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB1P16220 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB1P16220 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB1P16220 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CREB1P16220 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB1P16220 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB1P16220 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB1P16220 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB1P16220 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CREB1P16220 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CREB1P16220 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CREB1P16220 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CREB1P16220 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB1P16220 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB1P16220 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB1P16220 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CREB1P16220 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB1P16220 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB1P16220 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CREB1P16220 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB1P16220 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB1P16220 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CREB1P16220 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CREB1P16220 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB1P16220 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB1P16220 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB1P16220 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB1P16220 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB1P16220 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB1P16220 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB1P16220 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB1P16220 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB1P16220 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB1P16220 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB1P16220 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms