Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSP16219 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSP16219 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSP16219 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSP16219 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSP16219 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSP16219 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSP16219 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSP16219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSP16219 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSP16219 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACADSP16219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACADSP16219 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACADSP16219 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSP16219 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSP16219 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSP16219 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSP16219 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSP16219 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSP16219 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSP16219 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACADSP16219 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSP16219 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSP16219 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSP16219 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSP16219 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSP16219 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSP16219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSP16219 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSP16219 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSP16219 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSP16219 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSP16219 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSP16219 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSP16219 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSP16219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSP16219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSP16219 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSP16219 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSP16219 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACADSP16219 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACADSP16219 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACADSP16219 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACADSP16219 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSP16219 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSP16219 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSP16219 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSP16219 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSP16219 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSP16219 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSP16219 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSP16219 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSP16219 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSP16219 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSP16219 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSP16219 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSP16219 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSP16219 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSP16219 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSP16219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSP16219 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSP16219 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSP16219 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSP16219 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACADSP16219 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSP16219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSP16219 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSP16219 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSP16219 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSP16219 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSP16219 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSP16219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSP16219 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms