Protein–RNA interactions for Protein: P12757

SKIL, Ski-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKILP12757 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKILP12757 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKILP12757 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKILP12757 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKILP12757 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKILP12757 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKILP12757 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKILP12757 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKILP12757 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKILP12757 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKILP12757 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKILP12757 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKILP12757 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKILP12757 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKILP12757 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKILP12757 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKILP12757 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKILP12757 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKILP12757 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKILP12757 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKILP12757 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKILP12757 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKILP12757 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKILP12757 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKILP12757 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKILP12757 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKILP12757 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKILP12757 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SKILP12757 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKILP12757 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKILP12757 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SKILP12757 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKILP12757 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKILP12757 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKILP12757 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKILP12757 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKILP12757 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKILP12757 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKILP12757 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKILP12757 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKILP12757 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKILP12757 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKILP12757 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKILP12757 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKILP12757 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKILP12757 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKILP12757 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKILP12757 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKILP12757 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKILP12757 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKILP12757 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKILP12757 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SKILP12757 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKILP12757 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKILP12757 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKILP12757 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKILP12757 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKILP12757 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SKILP12757 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKILP12757 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKILP12757 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKILP12757 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKILP12757 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKILP12757 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SKILP12757 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SKILP12757 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SKILP12757 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKILP12757 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKILP12757 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKILP12757 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKILP12757 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKILP12757 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKILP12757 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKILP12757 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKILP12757 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKILP12757 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SKILP12757 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKILP12757 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKILP12757 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKILP12757 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKILP12757 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKILP12757 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKILP12757 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKILP12757 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKILP12757 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKILP12757 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKILP12757 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKILP12757 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKILP12757 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKILP12757 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKILP12757 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKILP12757 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKILP12757 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKILP12757 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms